Universität Salzburg
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Kurzbeschreibung
In der Core Facility Labor Molekulare Biodiversitätsforschung werden molekularbiologische und analytische Techniken vereint, die Biodiversität auf molekularer Ebene beschreiben kann. Es werden neben RNA und DNA auch z.B. Hormonproben bearbeitet. Es werden Methoden des DNA-Barcoding & Metabarcoding eingesetzt wie auch genomische und populationsgenetische Techniken.
Das schließt folgende Arbeitsschritte und nennenswerte Geräte mit ein:
- DNA-Isolation (Inkubatoren),
- PCR (Thermocycler und UV-Arbeitsstation),
- Gelelektrophorese und Geldokumentation, DNA-Aufreinigung, Next Generation Sequenzing (Covaris Ultrasonicator, Magnetic Bead Purification, Probenkonzentrator),
- Hormonextraktion (Orbitalschüttler, Vakuumzentrifuge).
Außerdem stehen ein Reverse Osmose Reinstwassersystem und div. Zentrifugen (inkl. einer Kühlzentrifuge) bereit. Die Core Facility Labor Molekulare Biodiversitätsforschung ist Partner von ABOL (Austrian Barcoding of Life).
Ansprechperson
Univ.- Prof. Jan C. Habel
Research Services
DNA-Isolation, PCR-Amplifikation einzelner Gene (inklusive DNA-Barcoding)
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Die Expertisen umfassen die Extraktion von DNA aus unterschiedlichen Proben, die DNA-Isolation, PCR-Amplifikation einzelner Gene (einschließlich DNA-Barcoding), DNA-Banking, Fragmentlängenanalysen (Mikrosatelliten Genotypisierung, AFLPs, RAD-seq) sowie Next Generation Sequencing, inklusive der Genomsequenzierung, Transkriptomsequenzierung, und der Anreicherung von Ziel-Genen (Targeted Enrichment). Weitere Expertisen umfassen die Extraktion von Steroidhormonen aus Blutplasma und Federn und die Quantifikation von Hormontitern mit Hilfe von Enzyme Immunoassays.
Haus der Natur Salzburg
2022-2025
Robert Schabetsberger
FWF-P26_P34091
Avian life history in the Anthropocene – a study of physiological, morphological, behavioural and fitness responses to rapid habitat change in an East African forest specialist (ANTHROBIRD)
Bis 2022
Beate Apfelbeck
DFG29611
Bombina variegata in Seekirchen am Wallersee: monitoring of yellow-bellied toads in a former gravel pit
2021
Kerstin Link, Andreas Maletzky
na
Austrian Barcoding of Life (ABOL)
2017-2021
Andreas Tribsch
BMWFW
https://www.abol.ac.at/
LIVE: Phylogenetic and ecological determinants of fungi-algae-bacteria associations in lichens along latitudinal and elevational gradients
1/01/22 → 31/12/25
Ruprecht, U. W.
FWF
Immortal titans: Does a germline exist in the titan arum?
Hörger, A. & Socher, S.
1/01/21 → 30/06/23
FWF
2022
Laina, D., Gfrerer, E., Scheurecker, V., Fuchs, R., Schleifer, M., Zittra, C., Wagner, R., Gibernau, M., Comes, H. P., Hörger, A., Dötterl, S.
Frontiers in Plant Science
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.838391/full
https://doi.org/10.3389/fpls.2022.838391
Occurrence of apomictic conspecifics and ecological preferences rather than colonization history govern the geographic distribution of sexual Potentilla puberula
2021
Flavia Domizia Nardi, Karl Hülber, Dietmar Moser, Henar Alonso-Marcos, Andreas Tribsch, Christoph Dobeš
Ecology and Evolution
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ece3.6455
https://doi.org/10.1002/ece3.6455
DNA-Barcoding bei verschiedenen Pflanzengruppen (Moose, Farne, Nacktsamer, Bedecktsamer)
2018
A. Tribsch
Acta ZooBot Austria
https://www.zobodat.at/pdf/VZBG_154_0213-0215.pdf