Kurzbeschreibung
In der Core Facility Labor Molekulare Biodiversitätsforschung werden molekularbiologische und analytische Techniken vereint, die Biodiversität auf molekularer Ebene beschreiben können. Es werden neben RNA und DNA auch z.B. Hormonproben bearbeitet. Es werden Methoden des DNA-Barcoding & Metabarcoding eingesetzt wie auch genomische und populationsgenetische Techniken.
Das schließt folgende Arbeitsschritte und nennenswerte Geräte mit ein:
- DNA-Isolation (Inkubatoren),
- PCR (Thermocycler und UV-Arbeitsstation),
- Gelelektrophorese und Geldokumentation, DNA-Aufreinigung, Next Generation Sequenzing (Covaris Ultrasonicator, Magnetic Bead Purification, Probenkonzentrator),
-Nanopore Sequenzierung
- Hormonextraktion (Orbitalschüttler, Vakuumzentrifuge).
Außerdem stehen ein Reverse Osmose Reinstwassersystem und div. Zentrifugen (inkl. einer Kühlzentrifuge) bereit. Die Core Facility Labor Molekulare Biodiversitätsforschung ist Partner von ABOL (Austrian Barcoding of Life).
Ansprechperson
Univ.- Prof. Jan C. Habel
Research Services
DNA-Isolation, PCR-Amplifikation einzelner Gene (inklusive DNA-Barcoding)
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Die Expertisen umfassen die Extraktion von DNA aus unterschiedlichen Proben, die DNA-Isolation, PCR-Amplifikation einzelner Gene (einschließlich DNA-Barcoding), DNA-Banking, Fragmentlängenanalysen (Mikrosatelliten Genotypisierung, AFLPs, RAD-seq) sowie Next Generation Sequencing, inklusive der Genomsequenzierung, Transkriptomsequenzierung, und der Anreicherung von Ziel-Genen (Targeted Enrichment). Weitere Expertisen umfassen die Extraktion von Steroidhormonen aus Blutplasma und Federn und die Quantifikation von Hormontitern mit Hilfe von Enzyme Immunoassays.
Haus der Natur Salzburg
2020
Anja C. Hörger und Stephanie Socher
FWF
https://www.plus.ac.at/environment-and-biodiversity-en/research-2/research-fields-of-botany/doetterl/projects/amorphophallus-titanum/?lang=en
Populationsgenetik der Gelbbauchunke Bombina variegata
2022/2023
Eberle, Link, Ramsimmer, Maletzky
ENNACON environment nature consulting KG
na
DNA Barcoding Zuckmücken / Stechmücken
2022/2023
Sommer, Eberle, Petermann
na
2023
Meusburger T, Lettner H, Hubmer AK, Hörger AC, Friedl G, Tippelt G, Marbach M
J Environ Radioact, 259-260:107102.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0265931X22002934
doi: 10.1016/j.jenvrad.2022.107102.
Variation in scent amount but not in composition correlates with pollinator visits within populations of deceptive Arum maculatum L. (Araceae).
2023
Gfrerer E*, Laina D*, Gibernau M, Comes HP, Hörger AC, Dötterl S
Front Plant Sci, 13:1046532.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9869488/
doi: 10.3389/fpls.2022.1046532.
Local insect availability partly explains geographical differences in floral visitor assemblages of Arum maculatum L. (Araceae).
2022
Laina D, Gfrerer E, Scheurecker V, Fuchs R, Schleifer M, Zittra C, Wagner R, Gibernau M, Comes HP, Hörger AC*, Dötterl S*
Front Plant Sci, 13:838391.
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.838391/full
doi:10.3389/fpls.2022.838391.