Labor für Metabolomik

FH JOANNEUM Graz

Graz | Website

Open for Collaboration

Kurzbeschreibung

Die betrachtete Forschungsinfrastruktur besteht aus zwei Labors und einem Versorgungsraum mit einer Fläche von rund 120 m2 plus zugehöriger Geräteausstattung. Das Labor für Metabolomik beherbergt mehrere GC/MS- und LC/MS-Systeme (Agilent 5975 Single Quadrupole MS, Agilent 7890 GC, Agilent 7890 GC-FID, beide mit Headspace Equipment, Agilent 6460 Triple Quadrupole MS, Agilent UHPLC 1260, Agilent 1260 Infinity LC, Agilent 1290 Infinity LC, Thermo LCQ Fleet Ion Trap MS, Thermo UHPLC Accela 1000) sowie Geräte zur Probenvor- und –aufbereitung (SPE-Equipment, SpeedVac, etc.). Weiters verfügt das Labor einschlägige Werkzeuge und Geräte zur Durchführung von immunologischen Methoden (BIO-RAD Standard ELISA Equipment, Beckman DTX 880 Multimode Detector, Geräte für die klinische Diagnostik). Spezialsoftware für den Bereich Design of Experiments (Umetrics MODDE) sowie für die statistische multivariate Datenauswertung und –interpretation (Umetrics SIMCA) steht zur Verfügung.

Ansprechperson

Mag. Dr. Bernhard Wagner

Research Services

Wir bieten Unterstützung bei der Abbildung von ganzheitlichen bioanalytischen Prozessen im Bereich der GC-MS/MS und LC-MS/MS Methodik, beginnend von der Planung, der Wahl der geeigneten Methode nach anforderungsorientierten Kriterien, sowie die Durchführung der Prozesse in unserem Labor.

Zu den angebotenen Leistungen zählen die Beratung und die Methodenentwicklung im Umfeld bioanalytischer Verfahren, die Datenverarbeitung und statistische Analyse, die Validierung von bioanalytischen Prozessen und die Datendissemination sowie Interpretation. Im Speziellen beschäftigen wir uns mit der Qualitätssicherung von pharmazeutischen Produktionsprozessen durch Identifizierung und Charakterisierung sowie Quantifizierung von Nebenprodukten bei der Herstellung von pharmazeutischen Produkten. Ein weiterer Schwerpunkt ist definiert durch die Analyse von flüchtigen und nichtflüchtigen Extractables und Leachables bei Lebensmittel- und Pharmaverpackungen. Ein weiteres Interessensgebiet beschäftigt sich mit analytischen Problemstellungen im Umfeld von Nahrungsmittelsupplementen auf Basis von sekundären pflanzlichen Metaboliten. Im F&E-Umfeld kooperieren wir mit Partnern aus dem universitären Bereich, indem wir ein umfangreiches Produktportfolio zur qualitativen und quantitativen Bestimmung von Biomarkern des oxidativen Stresses entwickeln und ständig erweitern. Diese Biomarker spielen eine Schlüsselrolle bei der Entstehung von prominenten Pathologien wie bei diversen Krebsarten, bei neurodegenerativen Erkrankungen und beim metabolischen Syndrom.

Die verfügbare Infrastruktur besteht aus GC/MS- und LC/MS-Systemen, sowie Systemen für immunologische analytische Fragestellungen (Agilent 7890 GC-FID, Agilent 7890 GC, Agilent 5975 Single Quadrupole MS, Agilent 7890B GC, Agilent 7010C Triple Quadrupole MS, Head Space Injector, Thermo UHPLC Accela 1000, Thermo LCQ Fleet Ion Trap MS, Agilent 1260 Infinity LC, Agilent 1290 Infinity LC, Agilent 6460 Triple Quadrupole MS, Beckman DTX 880 Multimode Detector).

Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur

Der Forschungszweig Metabolomik definiert sich durch einen innovativen sowie ganzheitlichen Ansatz bezüglich der Analytik von Stoffwechselprodukten (Metabolite) eines Organismus, wobei durch die intelligente Auswertung der erhaltenen Analyseergebnisse mit Hilfe multivariater statistischer Verfahren auf den physiologischen Zustand des betrachteten Organismus geschlossen werden kann. Durch oxidativen Stress induzierte Veränderungen im Metabolimus sind grundlegende Beobachtungsmerkmale in den Forschungsbereichen Bewegung und Ernährung sowie im Umfeld der Ätiologie von diversen pathologischen Erscheinungsbildern, wie z.B. Tumorgenese, metabolische Störungen und neurodegenerativen Erkrankungen. Die Etablierung eines Portfolios von high-end Analyseverfahren für Biomarker des oxidativen Stresses bilden daher die Basis des gegenständlichen Forschungsvorhabens "Oxidativer Stress" am "Labor für Metabolomik – Graz".

Wesentliche Schwerpunkte des Projekts liegen also in der Methodenetablierung und Weiterentwicklung sowie deren Applikation auf diverse Fragestellungen seitens der Interessenshalter aus Wirtschaft und Forschung. Gezielt werden analytische Techniken für Biomarker des oxidativen Stresses etabliert und auch gängige Analyseverfahren zur Abdeckung von spezifischen Fragestellungen seitens der Wirtschaftspartner adaptiert und optimiert. Konkret werden innovative Analyseprotokolle kontinuierlich entwickelt, die eine sensitive und exakte Quantifizierung forschungsrelevanter Metabolite zulassen, wodurch konsequenterweise ein umfangreiches analytisches Portfolio für Partner aus Wirtschaft und Forschung aufgebaut wird. Als weiterer Forschungsbereich ist die Analyse und Strukturaufklärung von sekundären Pflanzeninhaltsstoffen in Nahrungsmittelsupplementen und Naturstoffen definiert.

Als Werkzeuge werden chromatographische und massenspektrometrische Verfahren (GC/MS, LC/MS) sowie immunologische Techniken angewendet. Für die Planung von Experimenten werden statistische Verfahren (z.B. faktorielles Design) und zur Datenauswertung multivariate statistische Verfahren (PCA, PLS, HCA) eingesetzt.

Equipment

• Biomedizinische Analytik Massenspektrometer (Agilent 6400 Triple Quadrupole)