Kurzbeschreibung
Robuste Ionenfalle (amaZon SL) von Bruker, die durch eine MSn Fragmentierung für die Identifizierung von Molekülen geeignet ist, z.T. ist auch eine Quantifizierung möglich (Verwendung von internen Standards). Das Gerät kann Naturstoffe aller Art (von Aminosäuren, Peptiden, Pigmenten, Steroide und versch. Sekundärmetaboliten) sowohl aus Proben von Isolaten verschiedener Mikroorganismen oder auch aus dem Freiland identifizieren. Es gibt auch Anwendungen, bei denen Schadstoffe (z.B. Pestizide mit einer Ionenfalle) analysiert werden. Auch werden diese Geräte in der Proteomik eingesetzt (d.h., klass. Proteomics, wo Proteine zuvor verdaut werden und dann die Peptide anhand ihrer Masse dem Proteom zugeordnet werden). Zum Betrieb der Ionenfalle selbst werden eine Vakuumpumpe und ein Stickstoffgenerator eingesetzt. Das Gerät kann an eine Hochleistungs-Säule-Flüssig-Chromatographie (HPLC) inkl. Dioden-Array-Detektion (DAD) gekoppelt werden (Agilent HP1100).
Ansprechperson
Rainer Kurmayer
Research Services
Routinemessungen zur Identifizierung von Algentoxinen (m/z ca. 500-2500) sind nach Absprache jederzeit möglich, dzt. werden in den Sommermonaten vor allem Gewässerproben aus Badeseen auf Algentoxine (Microcystin) untersucht.
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Identifizierung und Quantifizierung von Sekundärmetaboliten bei Algen (Cyanobakterien) in Gewässern. Zum Teil handelt es sich um Algentoxine, die chromatografisch aufgetrennt (HPLC-DAD) und mittels analytischen Standards quantifiziert werden. Einzelne HPLC Fraktionen werden dann in der Ionenfalle identifiziert.
2) umfangreiche Mess-Serien oder die Entwicklung von Messprotokollen sollten in geplante Projekte eingebunden sein, und erfordern personelle Anwesenheit, Kooperation auf Basis von Benutzungsgebühr und/oder Ko-Autorenschaft
Subcellular location of toxin production in cyanobacteria (2019-2024), Rainer Kurmayer, Austrian Science Fund (P32193), https://www.uibk.ac.at/limno/slot/
EcoAlpsWater (2018-2021), Rainer Kurmayer et al., (EU) European Regional Development Fund , https://www.alpine-space.eu/projects/eco-alpswater/en/home
Jablonska, M., Cerasino L., Boscaini A., Capelli C., Greco C., Klemenčič A.K., Mischke U., Salmaso N., Kurmayer R. (2024). Distribution of toxigenic cyanobacteria in Alpine lakes and rivers as revealed by molecular screening. Water Research 121783, https://doi.org/10.1016/j.watres.2024.121783
Entfellner, E., Baumann K.B.L., Edwards C., Kurmayer R. (2023). 'High Structural Diversity of Aeruginosins in Bloom-Forming Cyanobacteria of the Genus Planktothrix as a Consequence of Multiple Recombination Events', Marine drugs 21: 638. https://doi.org/10.3390/md21120638
Purker, M., Dobrovolny S. , Kreuml M. , Hufnagl P. , Indra A. , Kurmayer R., 2023. Quantitative relationships among high-throughput sequencing, cyanobacteria toxigenic genotype abundance and microcystin occurrence in bathing waters, Science of The Total Environment 901:165934 https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.165934
Olokotum M., Humbert J.-F., Quiblier C., Okello W., Semyalo R., Troussellier M., Marie B., Baumann K., Kurmayer R., Bernard C. (2022). Characterization of Potential Threats from Cyanobacterial Toxins in Lake Victoria Embayments and during Water Treatment. Toxins 14(10):664, https://doi.org/10.3390/toxins14100664
Entfellner E., Li R., Jiang Y., Ru J., Blom J., Deng L., Kurmayer R. (2022). Toxic/bioactive peptide synthesis genes rearranged by insertion sequence elements among the bloom-forming cyanobacteria Planktothrix. Front Microbiol doi:10.3389/fmicb.2022.901762
Morón-Asensio R., Schuler D., Wiedlroither A., Offterdinger M., Kurmayer R. (2021). Differential Labeling of Chemically Modified Peptides and Lipids among Cyanobacteria Planktothrix and Microcystis. Microorganisms 9(8):1578. doi:10.3390/microorganisms9081578
Schwarzenberger A., Kurmayer R., Martin-Creuzburg D. (2020). Toward Disentangling the Multiple Nutritional Constraints Imposed by Planktothrix: The Significance of Harmful Secondary Metabolites and Sterol Limitation. Frontiers in Microbiology 11:2473 doi:10.3389/fmicb.2020.586120.
Kurmayer, R., E. Entfellner, T. Weisse, M. Offterdinger, A. Rentmeister & L. Deng, 2020. Chemically labeled toxins or bioactive peptides show a heterogeneous intracellular distribution and low spatial overlap with autofluorescence in bloom-forming cyanobacteria. Scientific Reports 10(1):2781 doi:10.1038/s41598-020-59381-w.
Simiyu, B., S. Oduor, T. Rohrlack, L. Sitoki & R. Kurmayer, 2018. Microcystin Content in Phytoplankton and in Small Fish from Eutrophic Nyanza Gulf, Lake Victoria, Kenya. Toxins 10(7):275. doi:10.3390/toxins10070275
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Kurmayer, R., L. Deng & E. Entfellner, 2016. Role of toxic and bioactive secondary metabolites in colonization and bloom formation by filamentous cyanobacteria Planktothrix. Harmful Algae 54C:69-86, https://doi.org/10.1016/j.hal.2016.01.004