Kurzbeschreibung
Die Protein Core Facility ist eine Technologieplattform der Medizinischen Universität Innsbruck, die als zentrale Serviceeinrichtung ein breites Spektrum an analytischen Methoden für die Separierung und Identifizierung von Proteinen, Peptiden und deren Modifikationen anbietet. Mit den von uns entwickelten bzw. etablierten Methoden werden Projekte mit zahlreichen Arbeitsgruppen und Institute der MUI, aber auch Projekte mit anderen Universitäten und mit Partnern aus der Industrie, bearbeitet.
Als derzeit wichtigstes Verfahren für die Strukturaufklärung werden verschiedenste Techniken basierend auf Massenspektrometrie (MS) eingesetzt. Die vorhandene Geräteausstattung ermöglicht Electro-Spray-Ionisation (ESI)-MS, sowie die Durchführung von MSn Techniken durch den Einsatz verschiedener Fragmentierungstechniken, wie z.B. HCD, CID und ETD. Um qualitative und quantitative Analysen (z.B. SILAC, TMT, iTRAQ, etc.) von Proteinen und Peptiden in komplexen Gemischen durchzuführen, werden Kopplungen mit nano-LC und CE eingesetzt.
Darüber hinaus werden umfassende technische und beratende Hilfestellungen bezüglich Versuchsplanung, Probenaufreinigung und -vorbereitung, sowie die Entwicklung projektspezifischer Methoden angeboten. Neben der Analyse von Proteinen und Peptiden werden auch quantitative Analysen von Aminosäuren und diversen Sekundärmetaboliten mittels Massenspektrometrie und HPLC, sowie Elementbestimmungen mittels Atomabsorptionsspektrometrie (F-AAS und GF-AAS) durchgeführt.
Ansprechperson
PD Dr. Bettina Sarg
Research Services
- Comprehensive protein identification of simple and complex protein digests from gel bands, immunoprecipitations (IP), and whole-cell/tissue digests by mass spectrometry
- Molecular mass determination of intact proteins or peptides
- Localization and quantification of post-translational modifications (phosphorylation, acetylation, methylation, deamidation, citrullination, etc.)
- Mass spectrometry supported determination of protein complex structure by identification of chemical cross-linked peptides
- Enrichment of phosphopeptides by Immobilized Metal Affinity Chromatography (IMAC, FeNTA, TiO2 etc.)
- Quantitative Proteomics using isotope labelling strategies (e.g., SILAC, iTRAQ, TMT, etc.)
- Lable free Quantification
- Chemical derivatization of proteins for the identification of the N- and C-terminal amino acid sequence
- Identification and quantification of complex protein mixtures applying data-dependent (DDA) and data-independent acquisition (DIA)
- Quantitative polyamine analysis
- Capillary electrophoresis-electrospray ionization-mass spectrometry (CESI-MS)
- Quantification of nucleotide/nucleoside-type molecules without derivatization using CESI-MS
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Proteinanalytik basierend auf LC-MS und CE-MS; Identifizierung, Charakterisierung und Quantifizierung von Proteinen und Peptiden und deren posttranslationalen Modifikationen; Quantitative Bestimmung von Aminosäuren und Spurenelementen in biolog. Matrices