Kurzbeschreibung
Das Forschungslabor für Molekulare Systematik umfasst ein Großraumlabor und einen DNA-Reinraum, dessen UV-Bestrahlung und ein gefiltertes Lüftungssystem die Untersuchung von alter DNA auf höchstem technischem Niveau ermöglichen. Die Laborausstattung umfasst die Gerätschaften, welche für die Durchführung von DNA-Analysen – vor allem im Rahmen von wissenschaftlichen Arbeiten zu Fragestellungen aus der Evolutionsbiologie, biologischen Systematik und Taxonomie – notwendig sind. Dazu zählen insbesondere DNA-Sequenzanalysen aus Proben von Museumsmaterial (Sammlungsobjekte), Mikrosatellitenanalysen, Artbestimmungen mittels DNA-Sequenzanalyse, DNA-Barcoding (Artidentifikation mittels DNA-Sequenzen) und Genom-Sequenzierungen.
Ansprechperson
Priv.-Doz. Dr. Luise Kruckenhauser (Leitung Forschungslabor für Molekulare Systematik)
Research Services
Die Einrichtungen stehen allen Abteilungen des NHM Wien für wissenschaftliche und routinemäßige Untersuchungen zur Verfügung, die zum Teil in Kooperation mit nationalen und internationalen Forschungspartnern durchgeführt werden. Nutzung durch Externe (kostenpflichtig oder im Rahmen von Kooperationen) nach Vereinbarung mit den zuständigen Kontaktpersonen möglich; wissenschaftliche Kooperationen, vor allem im Rahmen von drittmittel-geförderten Projekten möglich.
Nach Vereinbarung werden auch Auftragsarbeiten (z. B. Artbestimmung mittels DNA-Barcoding; genetische Typisierung, genetisches Monitoring) angenommen.
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Molekularbiologische Arbeiten zu DNA-Sequenzanalyse umfassen z. B. DNA-Extraktion, DNA-Extraktion aus Proben von Museumsmaterial („historische DNA“, hDNA), Polymerasekettenreaktion (PCR), Klonierung von PCR-Produkten, DNA-Visualisierung und -Qualitätskontrolle, Genom-Sequenzierungen, sowie Datenanalysen (z. B. DNA-Sequenzanalyse, Mikrosatellitenanalyse, DNA-Barcoding, eDNA-Barcoding).
Geräteausstattung:
Das Hauptlabor ist mit 7 Thermocyclern (Eppendorf), 4 Zentrifugen, mehreren verschiedenen Thermomixern, Inkubatoren sowie Kühl- und Gefriergeräten, einem Autoklaven, einem tragbaren Gerät zur „Nanopore“-Sequenzierung und einem Mikroskop mit Kamerasystem und Software zur Dokumentation ausgestattet. Für die DNA-Visualisierung und -Qualitätskontrolle stehen eine Agilent 4150 Tape Station, ein Qbit 3 Fluorometer und ein Geldokumentationssystem (FAS-Digi Pro) zur Verfügung.
Der DNA-Reinraum verfügt über ein gefiltertes Luftschleusensystem und UV-Strahlung, um kontaminationsfreie DNA-Extraktion zu ermöglichen (insbesondere von Museumsmaterial: „historische“ DNA, hDNA). Der Reinraum ist mit einer Retsch Kugelmühle, einer UV-Hood, einem Thermocycler, Thermomixern, zwei großen Zentrifugen mit Kühlsystem, einem Inkubator, einem automatisierten Nukleinsäure-Extraktionssystem (Promega Maxwell® RSC), einem Stereomikroskop für die Gewebeentnahme sowie einer Vakuum-Pumpe für Filter-DNA-Extraktionen (z. B. eDNA) ausgestattet.
Zuordnung zur Forschungsinfrastruktur
Zentrale Forschungslaboratorien , Naturhistorisches Museum Wien