Universität Graz
Graz
Kurzbeschreibung
DNA-Barcoding ist ein standardisiertes Verfahren zur Bestimmung von Organismen anhand eines bestimmten Abschnittes aus dem Erbgut (DNA). Dazu werden Sequenzabschnitte bestimmter Gene verwendet, anhand derer sich Arten unterscheiden lassen. Die entsprechenden DNA-Sequenzen (DNA-Barcodes) erlauben daher eine eindeutige Artzuordnung. Zuerst werden DNA-Barcodes von zuverlässig bestimmten Organismen ermittelt und in einer Referenzdatenbank gespeichert. Diese DNA-Barcodes stehen dann für Vergleiche zur Verfügung. Zur Bestimmung einer unbekannten Probe muss daraus der entsprechende DNA-Abschnitt sequenziert und mit den Sequenzen in der Referenzdatenbank verglichen werden. Auf diese Weise ist die Artbestimmung mittels DNA-Barcoding schnell und sicher möglich. Der Bestimmungserfolg hängt jedoch von der Qualität und von der Vollständigkeit der Referenzdatenbank ab. Im Rahmen der ABOL (Austrian Barcode of Life) Initiative wird an den beteiligten Institutionen eine qualitativ hochwertige Referenzdatenbank für unterschiedlichste in Österreich heimische Organismengruppen erstellt und versucht, DNA-Barcoding unter Anwendung neuester Methoden effizienter zu gestalten.
Ansprechperson
PD Mag. Dr. Stephan Koblmüller
Research Services
Generierung von DNA-Barcodes österreichischer Organismen und Optimierung bestehender DNA-Barcoding-Protokolle
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Erstellen von DNA-Barcodes (mittels Sanger-Sequenzierung)
Primerentwicklung
Etablierung von next generation sequencing-Protokollen zum DNA-Barcoden
Equipment der Core Facility
Universität für Bodenkultur Wien
Veterinärmedizinische Universität Wien
Universität Salzburg
Naturhistorisches Museum Wien
Universalmuseum Joanneum
Tiroler Landesmuseen