Kurzbeschreibung
Die Core Facility Biomolecular & Cellular Analysis (BmCA) bietet die neuesten Geräte und Methoden zur Charakterisierung von Biomolekülen bzw. biomolekularer Interaktionen, den zweiten Themenschwerpunkt stellt die Durchflusszytometrie zur Analyse und Sortierung von Zellen und zellulären Bestandteilen dar. Als dritter methodischer Schwerpunkt fungiert die Proteinkristallographie mit dem Zweck der Strukturaufklärung von Proteinen und Protein-Ligand Komplexen.
Ansprechperson
Irene Schaffner PhD, Elisabeth Laurent PhD, Georg Schütz PhD, Karin Kohlweiss BSc, Jakob Wallner BSc
Research Services
• Oberflächenplasmonenresonanzspektroskopie (SPR)/Biolayer Interferometrie/Isothermale Titrationskalorimetrie (ITC):
- Biacore T200
- Octet RED96e
- PEAQ ITC Automated
Bindung/Interaktion zwischen Biomolekülen: Proteine, kleine Moleküle, Oligonukleotide, Kohlenhydrate, Lipide, usw.
Affinität – Kinetik – Spezifität – Konzentrationsbestimmung
• Dynamische Differenzkalorimetrie (DSC):
- PEAQ DSC Automated
thermische Stabilität von Proteinen und anderen Biomolekülen
Tm-Wert – Thermodynamik des Entfaltungsprozesses
• Kombination von Lichtstreuung (LS), UV- und Brechungsindex (RI) Detektion mit Größenausschlusschromatographie (SEC):
- OMNISEC GPC/SEC-Multidetektorsystem
Molekulargewichte, Konzentrationen, oligomere Zustände von Proteinen und Proteinkomplexen
Reinheit einer Probe
• Proteinaufreinigung:
- ÄKTA go Flüssigchromatographiesystem
Präparative Aufreinigung von Proteinen im Labormaßstab
Finaler Aufreinigungsschritt für Proteinproben
• Dynamische Lichtstreuung:
- Zetasizer Nano ZSP
Partikelgröße (0.3 nm - 10 µm) – Zetapotential – Aggregationsverhalten – Ladung/isoelektrischer Punkt (pI) – Molekulargewicht
(unteres Limit ca. 1000 Da) – zweiter Virialkoeffizient – Diffusionsinteraktionsparameter (kD)
• Durchflusszytometrie:
- CytoFLEX S: 405 nm laser – 488 nm laser – 638 nm laser – 561 nm laser – violet side scatter resolution <0.2 µm
• Fluorescence activated cell sorting (FACS):
- Sony Sorter SH800S: leicht bedienbares chip-basiertes Zellsortiersystem – 405 nm laser – 488 nm laser – 638 nm laser – 561 nm laser
- MoFlow Astrios EQ: Hochgeschwindigkeits-Zellsortiersystem – 405 nm laser – 488 nm laser – 638 nm laser – 561 nm laser – 355 nm UV-laser – 6-Wege Sortierung – plate loader anwendbar auf 6- bis 1536-well plate
• Proteinkristallographie:
- Pipettierroboter mosquito® LCP
- Vollautomatisches Kristallisationsplattenmonitoring System Rock Imager 1000
- Mikroskop SteREO Discovery.V12
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Die Core Facility Biomolecular & Cellular Analysis (BmCA) versteht sich als state-of-the-art Analytiklabor mit Fokus auf biomolekulare Charakterisierung bzw. Charakterisierung biomolekularer Interaktionen, Proteinkristallographie sowie Durchflusszytometrie. Neben den neuesten Geräten und Techniken bieten wir außerdem die Möglichkeit, die zu analysierenden Proben optimal vorzubereiten. Neben Basislaborausstattung (Kolbenhubpipetten, Multikanalpipetten, Dispenserpipetten, kühlbare Zentrifuge, Vakuumfiltration, Analysewaagen, pH-Elektroden verschiedener Größen, Wasserbad, DeNovix Absorbtions/Fluoreszenzmessung etc.) stehen den Benutzern der Core Facility auch zwei PC Auswertestationen zur Verfügung, auf denen die zum Teil lizensierte Spezialsoftware der einzelnen Geräte jederzeit verwendet werden kann.
Neben der Verfügbarkeit der Geräte, bieten wir auch professionelles Training zu den jeweiligen Methoden sowie Beratung zum experimentellen Setup. Es besteht auch die Möglichkeit der Inanspruchnahme eines Rundum-Service, welches die Messung Ihrer Proben durch geschulte Personen und die Erstellung von experimentellen Berichten umfasst.
Equipment
- MoFlow Astrios EQ Sorter
- Octet RED96e System
- Surface Plasmon Resonance Spectrometer Biacore T200
- PEAQ Isothermal Titration Calorimeter Automated (Malvern Panalytical)
- PEAQ Differential Scanning Calorimeter Automated (Malvern Panalytical)
- Zetasizer Nano ZSP (Malvern Panalytical)
- Durchflusszytometer CytoFLEX S (2 Laser)
- Durchflusszytometer CytoFLEX S (4 Laser)
- Zellsortiersystem SH800 (Sony)
- Mikroskop SteREO Discovery.V12
- Vollautomatisches Kristallisationsplattenmonitoring System Rock Imager 1000
- Pipettierroboter mosquito® LCP
- OMNISEC GPC/SEC-Multidetektorsystem
- ÄKTA go Flüssigchromatographiesystem